出现阴茎部尿道疼痛的原因常见的有：一、阴茎部尿道的结石，导致排尿时出现梗阻，阴茎部尿道疼痛、尿流缓慢或尿线分散。二、炎症或其他原因导致的尿道狭窄，导致尿流通过阴茎部的尿道狭窄段时，出现明显的胀痛。三、外伤。如骑跨伤导致尿道球部的破裂或断裂，导致排尿疼痛或无法排尿。以上健康科普知识仅供参考，具体情况需到正规医院检查，由专业医师进行判断。切勿自行诊断、治疗。