对于腹泻消化不良的患者，药物治疗可以应用健胃消食的药物以及调节肠道菌群失调肠功能紊乱的肠道益生菌类药物来治疗，主要是由于对于消化不良的患者，一般的患者治疗的话可以应用改善胃肠功能促进胃肠动力的药物，但是该类患者由于存在腹泻的情况，可以适当的选择促进胃动力的药物，但是对于促进肠动力的药物是属于禁忌的，这样会加重腹泻的情况。调节肠道菌群失调肠功能紊乱的肠道益生菌类药物，除了能够起到调节免疫等作用以外，还能够有一定的助消化的作用，必要时要到医院就诊，遵医嘱应用药物。