肝内胆管结石和肝外胆管结石是相对的，就是左右肝管汇合部，汇合部以上的肝内胆管树、汇合部以上的胆道系统都属于是肝内胆管，肝内胆管如果产生结石，可以称为是肝内胆管结石。肝内胆管结石发生的病因远比肝外胆管结石要复杂的多，而且治疗起来也是很复杂的，造成的后果也会更严重。