阴茎出小水疱可能是以下原因所导致：1.如果阴茎局部受到了外伤，比如挤压伤或者碾压伤，可能会导致阴茎局部出现红色的小水疱，并且还伴有明显疼痛。需要进行局部消毒，并且使用抗感染的药物进行治疗，防止出现继发性感染。2.如果男性存在不洁的性生活，没有做好防护措施，有可能被传染上性传播疾病，比如生殖器疱疹，就会导致阴茎部位出现小水疱。在疱疹破裂以后，还会使局部出现糜烂、渗出等症状。在确诊以后，应当使用抗病毒的药物进行治疗，在治疗期间要禁止性生活。