大便时肛门疼痛，常见的原因有以下几种：一，如果患者存在肛管直肠恶性肿瘤，随着病情的进展，癌肿有时会堵塞肠腔，引起肠梗阻的症状。排大便时会引起出口梗阻型的便秘，导致局部疼痛，通过直肠指诊，置入肛门镜，可以明确诊断。二，如果患者便秘或腹泻，肛腺感染后形成脓肿，有时沿着直肠蔓延至直肠后间隙，排大便时会导致局部疼痛，行内镜下超声检查可以明确诊断。三，如果患者大便干结，有可能损伤肛管皮肤形成肛裂，用力排便时会使疼痛十分剧烈。