吗丁啉上市后的不良反应报告显示，此药常规使用普遍耐受性良好，不良反应较少，偶见患者服药后出现轻度的腹部痉挛、口干、皮疹、头痛、腹泻、神经过敏、倦怠、嗜睡、头晕等症状，有时会出现血清泌乳素水平升高、溢乳、男性乳房女性化等，但停药后即可恢复正常。吗丁啉属于胃促动力非处方药，用药前一定要仔细阅读药品说明书，按照说明书推荐的剂量和疗程使用比较安全。过量服药可能会引起胃肠道出血、机械性梗阻、穿孔、兴奋、意识改变、惊厥、定向障碍、嗜睡和锥体外系反应。因此，不可擅自超说明书用药，对此药过敏者禁用。