灌肠广泛地用于治疗消化系统疾病，如梗阻、炎症和便秘等；也可用于治疗一些妇科疾病，如输卵管积液、盆腔炎等疾病；灌肠也可用于治疗泌尿系统疾病，如肾功能衰竭引起的尿毒症。肠梗阻患者的主要症状是腹痛、排气和排便困难。灌肠能有效地刺激肠的蠕动，加速肠道内容物的排出，有利于缓解肠梗阻的症状。对于有便秘问题的人，如果经常好多天不排便，也可以使用开塞露或肥皂水灌肠可起到润滑肠道的作用。