急性胃肠炎发生时需要根据患者的临床症状来决定使用何种药物进行治疗。急性胃肠炎往往将与细菌或病毒感染引起的急性炎症性疾病，在这种情况下往往是腹痛、腹泻症状尤为明显，如果同时伴有恶心、呕吐、胃酸分泌过多导致反酸，烧心感的话可以使用奥美拉唑的。此时因为恶心、呕吐，所以一般是注射用药，口服用药时会刺激胃肠道黏膜加重病情，所以这种情况下注射奥美拉唑针剂是管用的，能够抑制胃酸分泌，减轻恶心呕吐的不适症状。但是此时也应该积极的使用药物抗炎或者抗病毒，治疗病根，另外就是使用止吐、止泻的药物缓解症状。