扁桃体炎的患者大部分都是受到一些诱因之后，导致的全身或者局部的抵抗力下降，隐藏在扁桃体隐窝当中的细菌和病毒，这些病原体就会乘虚而入，就会引起发病。诱因通常包括了受凉、过度劳累、烟酒过度、有害的气体刺激、艾滋病等。主要的一些致病菌是乙型溶血性链球菌、非溶血性链球菌、葡萄球菌、肺炎球菌、流感嗜血杆菌以及一些病毒等。通常细菌感染比较多见，细菌和病毒的混合感染也是比较多见的，还有一些会合并厌氧菌感染的病例。