慢性肾炎的病因、发病机制和病理类型各不相同。但开始的发病因素多为免疫介导的，仅有少数慢性肾炎是由急性肾炎发展导致的，这可能是急性肾炎未及时治疗，迁延不愈，最后转化成慢性肾炎。但是由于治疗慢性肾炎的药物，比如糖皮质激素，长期应用会导致肥胖、高血压、糖尿病、高血脂，继而会间接的引起肾脏损害。比如高血压引起肾小球血管的收缩，导致肾缺血；糖尿病引起肾小球基底膜增厚，导致糖尿病肾病；感染导致慢性肾盂肾炎等等，都会间接的促进慢性肾炎的发生和发展。