包茎有水泡要根据病因对症处理，具体如下：1、包皮炎，可以看到表面有水疱，出现感染后疱液积脓，伴有包皮红肿、包皮破溃、糜烂等改变。确诊以后，建议使用高锰酸钾溶液稀释以后局部湿敷，每次湿敷5分钟左右，湿敷完后，保持局部干燥，外涂抗感染软膏如百多邦软膏调理。2、疱疹病毒引起的水泡，常常呈成簇性分布，数目较多，并且伴有局部糜烂、疼痛，多有不洁性接触史，可以通过性接触传染。需要进行抗病毒治疗，可以口服阿昔洛韦片，并外涂阿昔洛韦软膏少许进行治疗。