治疗结肠溃疡的药物有很多，临床上最常用的有氨基水杨酸类药物，比如5-氨基水杨酸制剂，它可以减少肠壁的炎症，并预防疾病的发作，这些药物对轻度到中度的结肠病十分有效。皮质类固醇也用于缓解疾病的症状，对于中度到重度的炎性肠病患者通常需要在医院静脉注射这些药物。另外，生物制剂药物阻断了与炎症有关的化学物质，也可以作为治疗药物。生物制剂主要包括阿达木单抗、维多珠单抗。医生经常建议将这种药物作为皮质类固醇药物的替代品。因为皮质类固醇药物长时间应用会导致一些严重的不良后果。这种药物有助于控制疾病，并维持在缓解期内。