与普通的奥美拉唑肠溶片或者是胶囊相比，奥美拉唑注射剂作用更迅速，其适应症主要用来治疗不能通过口服药物来治疗的消化道疾病。常见的比如急性上消化道出血，急性胃黏膜病变，以及各种原因导致的幽门梗阻。同时奥美拉唑钠注射剂也可以用来治疗由于肝硬化所导致门脉高压性胃病出血以及用来治疗急性胰腺炎，机理应该是通过抑制胃酸的分泌，减少胃液量，从而能够减少胰液的分泌，减少胰腺的负担，通常需要配合生长抑素等综合治疗。