引起肛门湿疹的原因是有内因，也有外因。常见的内因包括一些基础性疾病，比如糖尿病、慢性消化系统的疾病、胃肠功能紊乱等。此外像精神紧张、焦虑、失眠、过度疲劳等，也会导致肛周湿疹的发生与加重。外因方面，肛周湿疹多与局部皮肤清洁卫生不良、潮湿多汗以及衣物比较紧，在局部摩擦刺激皮肤有关。另外，不适当的处理，如：热水烫洗、抓挠、刺激性的药物外涂等等，均可引起肛周湿疹加重。另外，如果患有痔疮，或者是局部真菌感染，也往往会刺激局部，引起湿疹样的改变。