慢性肾炎中，仅有少部分是由急性肾炎发展所致，大部分慢性肾炎的发病机制是免疫介导炎症。另外，非免疫、非炎症机制在疾病发展过程中起着重要的作用。例如，健全肾单位长期代偿处于血流高灌注、高滤过、高跨膜压的三高状态，久而久之导致健全肾小管硬化。目前认为慢性肾炎与急性肾炎之间无肯定的关联。它可能与各种细菌，病毒，原虫等感染，通过免疫机制，炎症介质因子和非免疫机制引起本病。