肾盂肾炎是泌尿系统感染中比较重的一种，绝大部分是细菌感染，也有极少部分是病毒、支原体、衣原体感染。如果做尿培养证实是细菌感染，可以服用在泌尿系统中浓度高的药物，例如喹诺酮药物、β-内酰胺类药物等等。喹诺酮药物主要是氧氟沙星或者左氧氟沙星，还有环丙沙星；β-内酰胺类药物主要有青霉素、阿莫西林、头孢等等。如果是病毒或者支原体、衣原体造成的肾盂肾炎，需要根据尿液培养来选择不同的药物进行治疗，应用药物以前需要判断病人的特殊情况，比如孕妇，年轻人特别是小于18岁的，以及哺乳期的妇女、老年人、有精神症状的病人等等综合判断应用什么药物最合适。