慢性肾炎的原因有遗传、药物、感染、自体免疫疾病及血管炎及不明原因的原发性肾小球肾炎。遗传：有些肾炎有家族性的终末期肾衰竭病史。药物：某些药物，如止痛药、含金化合物、某些抗生素等，亦会引发肾小球病变。感染：许多病毒或细菌的感染，均可并发肾小球病变。至于链球菌引起的咽喉炎或皮肤感染，则在小孩身上可引起急性肾小球肾炎。自体免疫疾病及血管炎：如红斑性狼疮，也会因免疫复合体的沉积而造成慢性肾炎。而有些自体免疫疾病，本身很少有肾炎表现，但使用的一些药物常导致肾小球病变。至于血管炎所造成的肾小球肾炎，情形通常比较严重，需要积极治疗。原发性：这在慢性肾炎患者中占了大多数，很多的环境因素、轻微的感染都可能是其原因。