随着厌氧菌培养技术的进步，已证实许多外科感染性病患与厌氧菌有关，厌氧菌大致分成两大类，即革兰氏阴性厌氧菌和革兰氏阳性厌氧菌。革兰氏阴性厌氧菌包括脆弱拟杆菌、狄氏类杆菌、多形拟杆菌、棱形杆菌等。革兰氏阳性厌氧菌包括破伤风杆菌、棱状芽胞杆菌、消化球菌等。腹部、泌尿生殖系统、齿龈、颅内感染以及败血症，常与厌氧感染有关。如最常见的急性化脓性阑尾炎，厌氧菌感染占有相当大的比例，又如齿槽脓肿，也以厌氧菌感染为主。