病因不同处理方式不同，例如使用坦索罗辛，可以缓解局部平滑肌的痉挛，使用保列治，可以缩小前列腺的体积。而前列腺炎，则需要加用一些抗生素来控制炎症。而对于结石梗阻，还有就是膀胱颈挛缩、尿道狭窄，则需要加用手术治疗，来疏通局部，这样方可达到治疗的目的。尿液分叉常见于后尿道梗阻性的疾病，例如前列腺增生、膀胱结石堵塞后尿道、尿道结石嵌顿，以及后尿道狭窄、膀胱颈挛缩、前列腺炎肿大等，都会导致尿液的分叉。