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在各型牙周病的病损区的菌斑细菌中常可分离出一种或几种优势菌,与牙周病的发生、发展密切相关。具有充分证据的牙周致病菌有伴放线放线杆菌、牙龈卟啉单胞菌、福赛坦菌。伴放线放线杆菌与侵袭性牙周炎关系密切;牙龈卟啉单胞菌是慢性牙周炎病变区或活动部位最主要的优势菌;福赛坦菌常在重度牙周炎的附着丧失处的龈下菌斑中检出。还有一些细菌如齿垢密螺旋体、具核酸杆菌、中间普氏菌等也有一定致病性。这些致病菌能通过多种机制干扰宿主防御能力,引发牙周组织破坏。