大便的时候屁眼疼痛的原因：1.考虑有肛裂的存在，肛裂一般就是在肛门口的位置，形成了皮肤的裂口，在粪便的刺激下，会出现疼痛的症状，尤其是大便干燥的情况下，疼痛的症状尤为明显。2.排除是不是由于痔疮当中的内痔发生了脱出，在回纳不及时的情况下发生了缺血坏死或者是外痔部分有水肿、血栓发炎的情况下，均可以引起大便时屁眼的疼痛。3.排除是不是由于肛门周围存在一些感染性的疾病，比如说有直肠黏膜下的脓肿，或者是肛门周围的脓肿，也可以出现大便屁眼疼痛的症状。