腰两边疼可能有以下几种原因：1、肾虚，如果出现了肾虚的症状就会出现腰膝酸软、疼痛，或者下肢无力的症状，这时可以口服六味地黄丸或者金匮肾气丸进行治疗。2、腰椎间盘突出，腰椎间盘突出压迫了神经就会出现两边的腰痛，同时可以伴有臀部以双髋部的不适。3、腰肌劳损或者腰背肌筋膜炎，常见于着凉或者长期弯腰工作的工人，这时就会出现腰两边的肌肉疼痛，特别是在晨起时疼痛比较明显，久坐或弯腰时也会加重。4、类风湿的疾病或者强直性脊柱炎，这两种疾病会累及腰背部以及骶髂部，而出现腰两侧的疼痛。特别是很多病人有晨僵的症状，在晨起时疼痛比较明显，而在活动一会之后疼痛就能有所缓解。