嗓子吞咽疼痛的原因较多，先考虑感染性因素，如急慢性咽炎、急慢性化脓性扁桃体炎、疱疹性咽峡炎、急性会厌炎或真菌病毒感染引发的咽喉部等多种疾病等。另外，咽喉部的肿瘤，如扁桃体恶性肿瘤、喉癌等。外伤如咽喉受到刺伤、挫伤、烫伤、烧灼伤或者误咽异物，如鱼刺、鸡骨头等卡喉损伤咽喉部，从而导致吞咽时疼痛等。另外，如果反流性食管炎或者因为手术或放化疗后致嗓子吞咽疼痛等都有可能导致吞咽时疼痛。因此对于嗓子吞咽疼痛，首先要明确病因，并且给予积极的抗炎、抗病毒等对症治疗。