反流性食管炎由胃食管反流病导致，因而其治疗也与胃食管反流病治疗相同。这是因为由胃、十二指肠内容物反流入食管中造成的食管损伤，特别是其中的胃酸、胃蛋白酶，所以可服抑酸药，比如：奥美拉唑、雷贝拉唑、雷尼替丁等来减少胃酸分泌；还可视病情加服促胃肠动力药，如吗多潘立酮、枸橼酸莫沙必利，以及黏膜保护剂，比如硫糖铝混悬液、瑞巴派特片。对于反流性食管炎的病人，还应服用抗酸药，如铝碳酸镁片，来中和反流入食管的胃酸，减轻对食管黏膜的损伤。