外用的有鬼臼毒素酊是抗有丝分裂的药，能破坏疣体，每天两次的外用，但是有致畸作用，孕妇是禁用的，另外80%至90%的三氯醋酸或二氯醋溶液均为腐蚀剂，通过对蛋白的化学凝固作用而破坏疣体，还有5%的咪喹莫特为局部的外用免疫调节药，刺激局部产生干扰素和其他细胞因子，还有5%的5-氟尿嘧啶霜，0.1%的博来霉素或平阳霉素溶液。另外还有干扰素，常用于局部皮损内注射的，其他的药物有胸腺肽，白介素，转移因子，丙种球蛋白，聚肌胞，左旋咪唑，卡介苗，自体免疫等，这类药物对尖锐湿疣的治疗，疗效尚存争议，一般只作为临床的辅助治疗。