阴茎根部有水泡，最常见的原因可能是炎症，也可能是过敏因素引起。炎症包括细菌感染、病毒感染，都会出现在阴茎根部有水泡。炎症引起的水泡要注意是否有不洁的性交史，如果有，一定要高度怀疑是疱疹病毒引起的。这种情况水泡有可能溃破，溃破后就有明显的疼痛。如果是普通的炎症引起，这种情况就类似包皮炎、龟头炎等表现，局部会有红肿，一般有疼痛，局部涂抹红霉素软膏很快就会缓解。病毒感染引起，要口服抗病毒治疗的药物，局部涂抹抗病毒治疗的药膏。过敏因素也是比较多见，主要就是新买的内裤，或者内裤频繁摩擦阴茎根部，导致局部出现过敏反应。这种情况会有痒，局部会有发红，清洗干净后局部涂抹炉甘石洗剂，口服抗过敏治疗的药物很快就会改善。