替硝唑和甲硝唑都是属于人工合成的硝基唑类的药物，都具有抗厌氧菌、抗滴虫、抗阿米巴原虫的作用。主要区别有以下三个方面：一、抗菌效果不同。替硝唑是属于甲硝唑的升级产品，该药物的抗厌氧菌、抗寄生虫的效果要比甲硝唑强。二、作用持续的时间不同。替硝唑作用持续的时间比甲硝唑要长，所以每天使用的次数要比甲硝唑少。三、副作用不同。替硝唑的副作用要比甲硝唑小很多，而且都比较的轻微。