月经总是不干净可能与内分泌失调有关。如果雌孕激素不均衡，导致子宫内膜较厚，易引起月经总是不干净。如果黄体功能不全，体内孕激素水平较低，易引起月经持续时间较长。另外，子宫卵巢的器质性疾病，出现多发性子宫肌瘤、子宫腺肌症或者子宫内膜息肉、粘膜下子宫肌瘤、子宫切口憩室，易引起月经总是不干净。