阴茎里面有疙瘩则建议到医院进行详细检查后明确病因，对症处理，具体如下：1、阴茎珍珠疹，多与包皮过长、包茎等因素有关，可以分布在龟头冠状沟周围或者包皮系带两侧，表现为柔软的肉芽样突起或者乳头样突起，表面光滑、没有出血、没有异味、没有局部的分泌物等，可长期存在，体积大小无明显变化，也不具备有传染性，可以无需任何治疗；2、如果有过不洁性接触后，出现阴茎里面的疙瘩，则考虑患有尖锐湿疣，多见于包皮、龟头、尿道口、会阴、肛周等多个部位，表现为乳头样或菜花样的突起，表面不光滑，可伴有出血、局部分泌物等，需要进行局部手术切除或者激光电灼，术后病理诊断为尖锐湿疣后，还需要肌肉注射干扰素治疗，常用的药物为重组人干扰素α2b，300万国际单位隔日肌注，连续肌注半个月。