反复发作的化脓性扁桃体炎，特别是一年4-5次以上，手术切除是最佳的治疗方案，也是根治的方法。因为扁桃体本身有6-20个隐窝，反复发作的急性扁桃体炎，会在隐窝内存有脓栓。当受凉、劳累等身体抵抗力下降时，脓栓爆发导致炎症感染，而且长时间的应用抗菌素对于身体的抵抗力是有危害的。长时间的不治疗会引起过敏反应，导致肾炎、皮肤性疾病等。有些过度肥大的扁桃体会引起咽喉部空间狭窄，而造成睡眠呼吸暂停，引起晨起时口干舌苦，白天精神不佳。