碘酒消毒伤口时通常会引起疼痛。这是因为碘酒的主要成分是酒精和碘。酒精在消毒时由于刺激损伤的皮肤黏膜，可以引起伤口的疼痛，每个人对疼痛的感觉不尽相同，且酒精引起的疼痛也与伤口的面积大小及深度有一定关系。如果皮肤破损的面积不大且不深，则疼痛一般是可以忍受的。而碘通常不会引起疼痛的感觉，因此，临床上对于婴幼儿皮肤黏膜损伤消毒时，通常选择碘伏而不用酒精，就是为了避免酒精引起的疼痛，也不建议用碘酒直接擦拭伤口。对于碘酒的应用，通常可以用于静脉注射或肌肉注射时皮肤的消毒，在没有伤口时也就不会引起疼痛。