砂仁味辛，性温，归脾胃和肾经，临床功效主要是化湿开胃、健脾止泻、理气安胎。所以在临床上对于湿浊阻滞中焦出现的脘腹痞满、不饿，或者是脾胃虚寒引起的腹痛，腹泻或者是湿阻中焦出现的恶心呕吐，都可以用砂仁配伍其他的药物，例如木香等，如香砂六君子汤来调理脾胃。另外，砂仁还具有理气安胎的作用，对于一些妊娠恶阻，有孕吐反应或者是胎动不安时，可以用砂仁，一般用量比较少，砂仁还是一位香料，在食物中也可以使用。砂仁性味辛温，能够香而走窜，有下气归元的作用，所以能够温肾下气，对于奔豚症或虚火上浮的症状，可以用砂仁起到温肾下气的作用。砂仁能够醒脾，温脾止泻，与高良姜或附子等配伍，以起到温中止泻的作用。