食管反流病可以吃PPI类药物，如奥美拉唑、兰索拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑，埃索美拉唑等，和H2受体阻滞剂，如雷尼替丁、法莫替丁、西咪替丁、尼扎替丁等。这些药物可以抑制胃酸分泌，从而有效降低损伤因素，是目前治疗胃食管反流病的主要药物。对初次接受治疗的患者或有食管炎的患者，宜用PPI类药物治疗。以求能够迅速控制症状，治愈食管炎。可以使用胃粘膜保护药，如铝镁加混悬液、硫糖铝等。这些药物可以中和胃酸，从而也可以减少胃酸对食管粘膜的刺激，但效果比较弱，仅用于症状轻或者是间歇发作的患者，作为临时缓解疼痛及反酸的症状时候使用。还可以使用促胃肠动力药，如多潘立酮、莫沙必利、伊托必利等。这类药物可以通过增加食管括约肌压力，改善食管蠕动功能，促进胃排空，从而达到减少胃内容物食管反流及减少其在食管的暴露时间。