射精后尿道会有疼痛，很可能就是有精囊炎或者前列腺炎。因为每次射精射出的精液，主要就是精囊内的精子、精囊内的分泌液和前列腺液。射精后大量的精囊的液体或前列腺内的液体，会一部分残留在后尿道，如果有炎症就会刺激后尿道疼痛。这种情况，建议平时一定要多喝水，规律的排精。应该做精囊彩超检查、前列腺液检查，要评估是否有精囊炎、前列腺炎等。如果有，就要对这两个病进行有效的治疗，避免出现射精后疼痛。长期射精后疼痛，严重影响性交的质量，也会导致自己不愿意性交。