在临床上对于肛周脓肿的治疗，主要是采取肛周脓肿根治术以及肛周脓肿切开引流术处理。术后需要选择高锰酸钾溶液、肛门洗剂、红油膏纱条以及京万红软膏等药物进行换药处理。但是对于皮下肛周脓肿比较小的情况下，可以直接选择抗生素进行消炎处理，进而控制感染进一步加重。