肛窦炎和痔疮的区别是局部的病变位置不同，临床症状也不同，肛窦炎的病变位置主要在齿线附近的肛隐窝，由于肛隐窝或者肛窦出现长期持续的慢性感染，从而引起患者肛门局部出现不同程度的疼痛感。炎症急性期还有可能出现肛瘘分泌物增多的情况，患者在排便时会发现大便上有黏液或者脓液，甚至肛窦炎持续感染，还有可能诱发肛周脓肿等其他的肛肠科疾病。而痔疮的病变位置在齿线附近的内痔或者是肛门口的外痔，并且临床症状主要是以便血、脱出或者肛门局部的疼痛为主，还有可能伴随有便秘或者肛门局部的瘙痒，通过相关的肛门指诊和肛门镜检查可以明确鉴别，肛窦炎主要是以局部齿线黏膜发红或者出现充血为主，而痔疮则表现为黏膜的隆起以及局部外痔和皮赘的存在。