引发三叉神经痛的原因有多种具体原因尚不明确，其中几种学说可能与三叉神经痛有关。第一，短路学说，认为神经髓鞘崩解可能引起相邻两纤维之间发生短路，轻微的触觉激发即可通过短路传入中枢。中枢传出冲动也可再通过短路成为传出冲动，达到痛觉神经元的阈值而引起疼痛。第二，脱髓鞘学说，三叉神经感觉根或半月节或三叉神经周围支受到压迫或损害，发生脱髓鞘性变，部分神经髓鞘脱离使原来神经素的抑制作用减弱或消失，增加三叉神经背核反向的自我激发及重复发放，使受损的神经变得敏感，产生疼痛。第三，病毒感染学说，如带状孢疹易累及三叉神经第一支引起疼痛。第四，其他遗传学说、神经学说、变态反应学说等等。