男人上厕所小便疼考虑为尿道炎、尿道结石以及外伤等因素导致的。尿道炎分为普通型尿道炎、淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎。由于炎症对尿道黏膜造成刺激，会引起尿道黏膜充血水肿，从而引起上厕所小便疼。如果有尿道结石，排尿过程中由于尿液冲击力，结石会刮伤尿道粘膜，也可以引起上厕所小便疼。如果阴茎受了外伤，比如剧烈的碰撞或者挤压，可以引起阴茎软组织以及尿道黏膜受损，排尿过程中由于尿液刺激，也可以引起上厕所小便痛。患者需要及时去医院泌尿外科进行检查并治疗。