临床上治疗尖锐湿疣主要是针对尖锐湿疣的疣体使用药物进行腐蚀治疗，可以在医生的指导下使用0.5%的鬼臼毒素酊，5%的咪喹莫特霜以及三氯醋酸或二氯醋酸等药物，进行局部的涂抹治疗。鬼臼毒素酊临床上治愈率较高，可以治愈90%以上的疣体；咪喹莫特可以清除60%以上的疣体，优点是复发率比较低。使用这些药物来治疗尖锐湿疣，都有局部刺激的副作用，都有可能出现瘙痒、灼痛、红肿、糜烂以及坏死的不良反应。因为尖锐湿疣的复发率比较高，为了预防复发，必要时还需要使用一些免疫疗法，可以选择注射干扰素、白介素等药物。