我国海水养鱼的历史，如从明代《鱼经》算起，已有400多年历史，但建国前发展较慢。近半个世纪以来，我国海水增养殖业得到长足发展，各地按照充分利用浅海滩涂，因地制宜养殖、增殖，鱼虾贝藻全面发展，加工运销综合经营的发展方针，把主攻方向放在巩固提高藻类,积极发展贝类,稳步扩大对虾，重点突破鱼蟹,加速拓展海珍品上，初步实现了虾贝并举、以贝保藻、以藻养珍的良性循环。
改革开放以来，我国海水养殖业一直处于稳步发展态势。具体表现为:养殖面积不断扩大，到1999年底，海水养殖总面积到109。 5 x104hm2。总产量不断增加，1999年全国海水养殖总产量为974。 30 x104t，目前我国海水养殖占世界海水养殖总产量的70%左右，成为世界海水养殖大国。
养殖品种增多，且名特优种类所占的比重提高。据初步统计，目前海水养殖的鱼、虾、蟹、贝、藻等品种有60多种。养殖模式向多元化发展,根据不同的养殖品种采用不同的养殖模式,根据投资力度不同选择不同的养殖模式。但是随着生产的扩展，养殖总量超过水域容纳量，对环境所造成的负面影响也日益显露出来。
一些主要养殖区域有害赤潮发生频繁，环境污染加剧，病害成灾面积不断扩大，然而对大面积暴发性病害尚未找到有效的控制办法，每年因此而造成的经济损失十分惊人。同时,作为养殖行为主体的农渔民，由于把握市场，分析市场,竞争市场的能力较弱，故在养殖经营上存在相当的盲目性、粗放性和无序性，海水养殖存在很多问题。
一是缺乏整体开发利用的战略意识，包括布局不合理，养殖模式和管理混乱，与其他相关产业的冲突不断;二是养殖环境恶化、生态系统失衡，污染的来源包括工农业和生活污水，也包括海水养殖自身污染，造成生态系统失衡，赤潮频发，以及养殖活动干扰或破坏了野生生物的生活环境等;三是缺乏品质优良、抗逆能力强的养殖对象；四是养殖类群单一并长期持续密集养殖，致使病害肆虐。