在临床上药物治疗抑郁症是作为一线的首选的治疗方案，特别是对于中度或重度以上的抑郁症患者。在临床治疗上首选的一线的药物是五羟色胺再摄取抑制剂，如文拉法辛，度洛西汀，帕罗西汀，氟西汀，舍曲林，艾司西酞普兰，米氮平等药物。这些药物的应用临床，坚持一个原则，一要足疗程治疗，二要全病程治疗，三要单一用药。在治疗效果欠佳时，可以联合两种以上的药物进行治疗。另外也可以选择应用传统的抗抑郁药物，如马普替林，阿米替林，氯丙咪嗪等药物系统规范的治疗。