治疗支原体肺炎，大环内酯类或者呼吸喹诺酮类是作为首选的抗感染治疗药物。大环内酯类常用的药物有阿奇霉素、红霉素等。呼吸喹诺酮类主要是左氧氟沙星、莫西沙星等。在我国肺炎支原体对大环内酯类的耐药率较高，对明确诊断或高度怀疑肺炎支原体肺炎的患者，如果大环内酯类的药物治疗无效，满18岁以上的患者建议换用呼吸喹诺酮类或者是四环素类的药物进行治疗。