苍耳子的副作用是茎叶中含有对神经及肌肉有毒的物质。中毒后全身无力、头晕、恶心、呕吐、腹痛、便秘、呼吸困难、烦躁不安、手脚发凉、脉搏慢。严重者出现黄疸、鼻衄，甚至昏迷，体温下降，血压忽高忽低，或者有广泛性出血，最后因呼吸、循环衰竭而死亡。