小便臭最常见于结肠膀胱瘘的病人，结肠膀胱瘘时会有大便排到尿液中，会出现小便臭的现象。小便臭还见于病人发生泌尿系感染，如感染的致病菌为粪肠球菌或屎肠球菌，常常会引起尿液发臭的气味。病人出现急慢性尿潴留时，由于潴留尿液中大量致病微生物繁殖，会出现尿素分解产生氨气，会出现小便臭的症状。病人发生真菌感染时，如白色念珠菌引起尿道炎时也会出现小便发臭的现象，病人发生淋菌性尿道炎时也会出现尿道脓性分泌物，会出现恶臭的现象。