新生儿在进行维生素D3补充的时候，一定要注意以下几点。首先是新生儿出生后两周的时候，新生儿的父母要常规给新生儿补充维生素D3，从而有效的预防维生素D缺乏性佝偻病。其次是在新生儿血液中维生素D和微量元素钙等营养缺乏的时候，再给新生儿补充维生素D3是比较理想的，在这种情况下，新生儿会有相应的症状，比如会出现枕秃、鸡胸、出汗比较多、夜间哭闹不好等症状，家长可以给新生儿补充维生素D3，并且可以根据血液中的化验水平来进行药量调整。综上所述，新生儿出生后两周可以常规的补充维生素D3，但是补充维生素D3的时候，最好要根据血液中维生素D的水平来动态调整。