目前认为主要分为两个方面，一个是内源性的原因，另一个是一些环境的因素。内源性的原因，目前并不是完全明确，有显示一些先天性的遗传性的甲状腺激素合成缺陷，是可以导致甲状腺肿的；还有一些自身免疫或者炎症反应，也可以导致甲状腺肿，比如Graves病，就可以表现为弥漫性甲状腺肿；还有甲亢，像桥本氏甲状腺炎就是在甲状腺肿的基础上，可以表现甲状腺功能正常、甲亢或者甲减。环境因素主要是包括碘，碘是甲状腺合成甲状腺激素的重要原料之一。碘缺乏时，合成的甲状腺激素不足，会反馈地引起促甲状腺素增多，从而刺激甲状腺的增生肥大。像地方性甲状腺肿，最常见的原因就是碘缺乏病，当然碘缺乏病不是唯一的致病因素，还包括一些遗传因素的参与。另外，一些碘造影剂胺碘酮，都是一些常见的导致甲状腺肿的来源。另外，自然界的一些天然食物中也含有一些致甲状腺肿的物质，比如卷心菜、甘蓝、大头菜、核桃、油菜等等。还有吸烟也可以导致甲状腺肿的发生。另外是环境内分泌干扰素、很多化学合成的污染物，也参与了甲状腺肿的发生。药物因素，常用来治疗双向躁狂抑郁型的精神病的锂剂，服用锂剂的患者是可以出现甲状腺肿大的。