治疗尖锐湿疣的药物主要是抗病毒药物，常用的有阿昔洛韦、伐昔洛韦。口服的治疗疗程大概是在1到3个月左右，具体的疗程要根据患者的情况来决定。尖锐湿疣的患者还可以适当的口服一些提高免疫力的药物，比如说转移因子胶囊、匹多莫德等等，这些提高抵抗力的药物，有助于患者的恢复。另外，尖锐湿疣的患者还可以使用一些外用的药物进行涂抹，比如具有清除疣体作用的咪喹莫特软膏、鬼臼毒素、干扰素等等。如果使用口服药物和外用药物治疗效果都不好，建议患者使用一些手术的方法来处理的，比如二氧化碳激光手术、高频电刀、微波治疗、液氮冷冻术。