肾囊肿主要是先天性因素以及后天性因素导致的。先天性因素可以导致肾囊肿，比如多囊肾，属于家族遗传性疾病，但也不排除基因突变的可能。后天性因素主要是肾小管憩室扩张导致的，和感染、饮食、毒素、情绪都有一定关联。如果发生感染，比如上呼吸道感染、尿路感染、胃肠道感染，都会导致肾囊肿的形成。毒素方面包括化学药物、肾毒性药物、农药、污染等。不良生活习惯和饮食习惯也会导致肾囊肿的形成。肾囊肿是临床上常见性疾病，大多数肾囊肿不需要治疗。