慢性腹泻首先要查明并去除原因。慢性腹泻的原因有病原微生物感染、肠道菌群失调、肠易激综合征、甲亢等。针对不同病因吃不同的药，如病原微生物感染导致的要行大便培养及药敏，并根据药敏结果用药。肠道菌群失调的药口服一些益生菌。甲亢导致的要吃硫脲类或咪唑类药物。肠易激综合征导致的要是蒙脱石散或洛哌丁安等。