来月经肛门疼，可能与以下因素有关：1.在月经期间，由于体内激素水平会出现改变，可能会对胃肠道造成影响，会使女性出现腹胀、排便次数增多以及便秘等情况，在排便时就会感觉到肛门疼痛，在月经期过后通常会自行缓解。2.在月经期间，由于有少量的盆腔积液形成，当盆腔积液积聚在腹腔最低部位时，也会使女性出现明显的肛门不适，比如疼痛、坠胀感等。3.如果女性本身存在肛裂、痔疮等疾病，在月经期间，这些疾病可能会加重，就会导致肛门疼痛，可能还伴有大便出血。